Citat:
Ursprungligen postat av
Statsbeslag
Skulle det fungera med tvåstegs elektrofores där den första sorterar större gener och den andra sorterar oligonukleotider som framställs genom att slå sönder rätt gen som isolerades i första steget?
Nej. För det första så behöver du hitta en metod som har förmåga att sönderdela genomet i 20 baspar långa fragment. Jag har inga tips på hur du åstadkommer det ens med modern teknik. Visserligen är det inget jag själv behövt göra särskilt ofta. Med hjälp av "sonication" kan du få fragment på 500-1000 baser skulle jag tro. DNase äter ju upp hela DNAt så det kommer inte heller hjälpa dig.
För det andra kommer det vara antagligen vara omöjligt för dig att hitta rätt sekvens i soppan om du skulle lyckas, oavsett hur många elektroforeser du gör. Du kommer ju inte på något sätt selektera för sekvens, enbart längd.
Om du refererar till 2D-elektrofores så är det för proteiner, då dessa först sorteras per storlek, därefter iso-elektrisk punkt. DNA kan enbart sorteras per storlek.